持續的疫情給實驗室帶來了壓力,使其不得不提升工作的智能化水平,提高效率,以確保盡可能地減少疫情對現有檢測體系的影響。因此,位于美國康科德,隸屬于新罕爾州公共衛生實驗室的蟲媒病毒檢測實驗室采用了自動化的樣本混合流程來進行西尼羅病毒 (WNV) 和東部馬腦炎 (EEE) 病毒的檢測。
蟲媒病毒,專指所有通過節肢動物攜帶者(如蚊子和扁虱)傳播的病毒,其中就包括西尼羅病毒和東部馬腦炎病毒,兩者均能經由感染蚊子的叮咬感染人類。一些監測項目能夠為如何應對這些蚊媒傳染病提供有價值的數據,公共衛生實驗室的蟲媒病毒檢測實驗室所運營的項目就是其中之一。
與各地的很多實驗室一樣,疫情迫使蟲媒病毒檢測實驗室對其蚊子監測項目進行了巨大的改變,采用了借助 ASSIST PLUS 移液工作站的自動化混合樣本檢測工作流程。實驗室主管Denise Bolton解釋說:“我們意識到,對于檢測物資的需求激增、有限的PCR儀器產能以及實驗室工作人員的巨大壓力還將持續一段時間。早在疫情之前,我們就一直在考慮嘗試一種用于蟲媒病毒監測的混合檢測模型,而現在,我們認為是時候該實施這種方法了。"
轉向混合檢測
在研究了混合檢測方法并為實驗室設計了方案后,他們通過檢測不同濃度的WNV/EEE陽性樣本組合進行了“概念驗證"。實驗證明,在由4份試樣組成的混合樣本中,即使是非常低濃度的陽性樣本也能被檢出。“驗證實驗顯示了很高的準確度和靈敏度,我們在2020年夏天應用了混合樣品檢測流程,初采用手動進行樣品混合。蚊子的處理是一項非常繁重的工作,很多步驟都需要打開和蓋上試管以及移取樣品,并且所有步驟都必須嚴格遵循安全流程來執行。額外的樣品混合步驟讓整個步驟更加繁瑣了,需要占用實驗員超過一小時,且需要高度的集中和專注。從質控的角度來看,在處理過程之后增加一個手動的混合步驟也是很有風險的,我擔心實驗員可能會出錯。"
降低出錯概率
為了盡可能地降低出現手動處理錯誤的可能性,該實驗室決定在一臺ASSIST PLUS移液工作站上將樣品混合過程自動化。“我很熟悉ASSIST PLUS,因為我們用它來處理我們的樣品,"Denise說。“隨儀器提供的VIALAB軟件讓編寫混合程序變得非常輕松,而INTEGRA移液器的靈活性意味著我們無需改變我們的蚊子處理方法。我們使用ASSIST PLUS配合一臺8通道的VOYAGER可調槍頭間距移液器來將試樣從2 ml試管中轉移到96孔板中,以構建包含4份樣本的200 µl混合樣本。該過程完成后,ASSIST PLUS會直接將裂解緩沖液加入混合樣本,隨后整個混合樣本將被用于核酸提取。這簡化了處理過程,節省了時間并且減少了塑料實驗室器具的使用,因為我們不再構建大體積的混合樣本然后移取等分來進行提取了。如此應用ASSIST PLUS讓我們得以將2個此前需要手動執行的步驟自動化,實現了2個移液步驟的自動化,實際上減少了對用戶輸入的需求。"
節省時間和經費
對蟲媒病毒監測采用了混合檢測后,提取和PCR試劑節省了75%,監測項目對PCR儀器的使用也減少了。“使用ASSIST PLUS移液工作站進行樣本混合節省了實驗員的寶貴時間,更重要的是,它讓我們確信整個過程中復雜的步驟正在無誤地執行,"Denise 總結道。
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